Le BRGM s’est lancé dans un vaste « chantier » en 2011 de réorganisation de ses directions. Elle vise à atteindre plus d’efficacité en reposant sur des directions claires, aux responsabilités bien identifiées et assure la synergie entre les équipes ainsi que la transversalité des projets : les nouveaux programmes garantissent la continuité de l’activité scientifique du BRGM. Elle recherche une cohérence accrue au sein du groupe formé par le BRGM et ses filiales, et renforce le contrôle interne par la création d’un service chargé de l’audit. Ce grand chantier repose sur : plus de clarté dans les missions et les objectifs de l’établissement, une rationalisation de l’organisation, la transversalité dans le pilotage des projets et la visibilité en région. L’ancienne structure en « râteau » juxtaposait une dizaine de services recoupant les différentes thématiques. 

La mise en place de 6 directions opérationnelles 

Cette nouvelle organisation s’achève en 2012, avec la création de 6 directions opérationnelles et d'une direction scientifique et de la production.

Les 6 directions opérationnelles se répartissent en 3 directions thématiques : les géoressources - l’eau, l’environnement et les écotechnologies - les risques et prévention. Et 3 directions transverses : les laboratoires, les systèmes d'information et les actions territoriales.

L’ambition majeure de ce remaniement interne est d’aboutir à ce que la fonction de Service géologique national soit portée par le BRGM dans son ensemble.